PCR是1984年開始出現(xiàn)的一項基因檢測技術，由于PCR技術具有簡便易行、敏感度高等優(yōu)點，該技術被廣泛應用于基礎研究和臨床檢測，成為分子生物學必要的研究工具。傳統(tǒng)的PCR定量是應用終點PCR來對樣品中的模板量進行定量，通常用凝膠電泳分離，并用熒光染色來檢測PCR反應的擴增產物。但在PCR反應中，由于反應體系和反應條件等因素會影響PCR反應效率，甚至出現(xiàn)一些非特異性擴增產物。因此，用終點PCR法來定量并不準確。
熒光定量PCR是1996年推出的一種新的定量技術，該技術克服了PCR法進入平臺期后定量的較大誤差問題，實現(xiàn)DNA/RNA的定量，而且具有敏感度和特異性高、能實現(xiàn)多重反應、自動化程度高、實時和準確等特點，該技術在醫(yī)學臨床檢驗及臨床醫(yī)學研究方面都有著重要的意義。
熒光定量是通過殺滅熒光源，使試劑發(fā)出熒光，從而誘導對應的dna的復制，從而檢測到dna的結構變化，他的熒光源一般是react熒光抗體，目前在熒光定量的實驗中使用react檢測基因序列的變化。可以用來檢測轉錄組、信號通路組、外顯子組的轉錄或翻譯能力的變化等，這些轉錄組數(shù)據(jù)以及信號通路的數(shù)據(jù)將決定在熒光實驗方面的分析結果，特別是基因組dna的反轉錄活動，在轉錄組數(shù)據(jù)分析中具有一定的重要意義。
熒光定量PCR操作的關鍵在于RNA的抽提和引物的設計。RNA的抽提需要嚴格進行RNasefree的操作，抽提的RNAOD260/OD280需嚴格控制在1.9-2.1之間。引物設計主要的考慮是其PCR反應特異性好和擴增效率高，進行PCR反應時無非特異性的條帶和引物聚合體出現(xiàn)，盡量選取GC含量在40-60%的區(qū)段進行擴增。另外，還需要適應熒光定量PCR儀上機條件的設定，退火溫度在55-65°C之間。除此之外，其他各個環(huán)節(jié)如試劑的穩(wěn)定性，RNA反轉的質量好壞，PCR上機條件的設定，加樣的手法和熟練度等等也要注意。
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